莫凡迁至魔都，卷入“秘密事件”的调查中。过程中，莫凡帮助唐月脱困，意外获得玫炎火种，再度觉醒双系，目标直指明珠学府。大学生活开始，召唤系迎来“斗兽大赛”的挑战。
龙武二十七年，天空突降怪雪，此雪不寒且温，亦不融，后世称之为“暖雪”。在 “暖雪“降下后的三个月，除魔组织“慈母教”的头号刺客狴犴奉命前往皇城，在这段路途中，关于这王朝由盛转衰、四大家族逆天而行的历史碎片徐徐展开……
剑与魔法的世界——艾斯克里亚。在这个世界里，人们生来就背负着等级与既定使命。战士、格斗家、僧侣、魔法师、盗贼、商人、猎人、咒术师、国王、贤者、勇者。而其中数量最多、毫无力量、最弱小的角色……“村民”。某日，一对村民父子遭遇魔物袭击。当那位青年飒爽登场，轻松击倒怪物时，那对父子惊得目瞪口呆。“镜浩二、村民……等级……999！？”达到 LV999 的极致境界，反抗既定命运的村民——镜浩二。魔族之巅的魔王之女——爱丽丝。两人相遇后，与伙伴们共同追寻魔族与人类共存的理想。在这个被命运赋予“对立”的世界里等待着他们的，将是这个世界不为人知的法则。
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在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
