架空的科学修真世界，所有人都享受着修真带来的便利。同时，另一个空间里，灵力日益贫瘠的妖界正对生机勃勃的人界虎视眈眈。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
苍云界，仙魔两道相争不断。 徐长青出身青莲剑谷，一心想当剑仙，好景不长，苍月宫第九魔将入侵青莲剑谷，徐长青爷爷牺牲，徐长青获得“青莲帝剑”的认可，与第九魔将对抗不敌。后昆仑太白剑仙秋无涯赶到，击退魔门，将徐长青和牧紫熏带至昆仑。昆仑众真人想夺青莲帝剑，被秋无涯呵止。徐长青觉醒了自己的仙灵“混沌聚灵碑”，被秋无涯收作弟子。在仙剑大比中，徐长青击败夏青候夺得头冠，获得进入昆仑禁地的资格，为了找到能够复活爷爷的不老神泉，徐长青选择踏入凶险的昆仑禁地。
洛离从⼩被困于⽆灵之地银州⼤陆，成为天绝杀堂的第⼀杀⼿。⽗亲慈云⼤师牺牲⾃⼰为洛离换来⼀线⽣机，让其逃离银州，前往中天主世界去寻找真正的修仙之路。
24岁的白领凛子，是一位独自居住的秘密宅女。 在繁忙日常的间隙，她总是通过最最最爱的动漫和漫画来治愈每日的疲惫。 但每次看动漫时，右侧隔壁总会传来抗议的猛烈“撞墙”声！ 凛子请左侧那位清爽绅士邻居·佐槻帮忙， 打算隔墙与对方沟通，谁知墙壁突然被踹破， 出现在眼前的，竟是凛子最爱的漫画《兔猫社》原作者·兔春老师！？ 而且这位兔春老师（本名右沙田），连佐槻房间的墙壁也一并撞坏了……
