据IGN报道，《尼尔：自动人形 Ver1.1a》已决定制作第二季，并公布了第二季预告。西历5012年。突然入侵地球的外星人与其制造的机械生物导致人类面临灭亡危机。仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用人造人士兵展开反攻作战。 然而无限增加的机械生物阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人「寄叶」部队至地球。刚被派往地球的「2B」与先行调查员「9S」会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……
闫月出回到故乡工作，在入职的公司里认识了新的朋友，在一次进入XY密室馆游玩密室游戏后，他发现自己被密室馆的老板许爱幽所吸引。然而，这却是他陷入一个又一个诡异密室幻境的开始。与此同时，随着闫月出与许爱幽的接触，越来越多的事件接连发生在闫月出的身边，这些事件甚至将他的朋友也卷入其中。闫月出在破解密室与寻找事件黑手的过程中逐渐触碰到了当年那段被隐藏的事件真相……
由于多次抛弃队友逃跑，哀木涕受到了朋友们的鄙视，没有人愿意再和他一起冒险。沮丧的他获得了一件神奇的道具——草裙娃娃，只要摇一摇就能回到过去，从头开始。哀木涕依靠这件宝物回到了认识傻馒之前，幻想彻底改变命运。可他的任性反而引发了一连串的风波，甚至激起了联盟和部落的矛盾，导致了战争发生！眼看曾经的朋友们又一次陷入危机，哀木涕终于意识到了自己的错误。他再一次摇起草裙娃娃，而这一次不是为了逃避，而是为了自我救赎……
这是和数个怪异交织在一起的微不足道的友情和别离的故事。 返老还童的怪异“月读的变若水”，绝对不能读出声来的“异界之歌”， 来路不明的书不知不觉间排列在书架上“逆偷盗的本”， 神隐的实况记录报告“仙境异闻”···首都范围内的某个中心车站， 这个小镇究竟在发生著什么…… 残留在令和世上最后的迷宫， “现代怪异”的mystery 志愿成为不足为道的小说家， 绪川董子和搭档的童颜细目的魔少年化野莲发起了挑战! 追求的是超自然知识和体力的胜负。 在解开这个小镇涌现出的数个怪异的二人前方等待的是…
沉寂三载，学院天才重回巅峰。 这一次，把三年失去的一切都拿回来！
