《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
这是一个贪婪膨胀，人类越来越难以得到满足的世界。 自古以来人们通过对银河星宿祈愿来实现自己梦想。而在如今科技—人工智能发展快速，在欲望膨胀的环境下，银河星宿之将被来自多维空间的晦王以邪恶之力所控制，同时来自外星辰的七星魁带着星曜的力量出现，帮助人类获得召唤铠甲勇士的力量。 星曜铠甲为了人类世界的和平与晦能战斗的使命，同时也为恢复星宿之将能继续为人类的梦想—祈愿而战斗
霍雨浩结束交换生生活回到史莱克学院后，和贝贝、徐三石、和菜头等人一起参加了海神缘相亲大会，并在大会上与恢复女儿身的王冬儿相认定情。但没过多久，史莱克学院转来了一个和王冬儿长得一模一样的女孩——王秋儿。新一届全大陆高级魂师学院斗魂大赛在即，霍雨浩一行决定代表唐门出战
冰川小雪是一位内向的学生，她总是向外筑起一道高高的心墙，只跟儿时好友安昙美姫互动。有一天，名叫雨宫凑的男孩，没来由地开始试图打进小雪的心房，扰乱了她平静的生活。 孤僻的小雪、受欢迎的美姫、没有边界感的凑和散漫的篮球员阳太，一起共度尴尬、偶有挫折却很充实的学生生活。
“我们永远都是好朋友啊”在那个懵懂的夏末，隼人（土岐隼一 配音）与最重要的哥们许下了约定。七年后，当隼人转学到都市高中时，重逢的青梅竹马春希（长谷川育美 配音）竟出落成清纯可人的美少女。被称作高岭之花的春希，在和隼人独处时就会用从前的亲昵方式对他展露笑颜。乡村与都市，少年与少女，成长的心灵与身体，纵然分离的时光改变了些什么，但始终不变的思念与约定依然存在。
