舞台设定在崇拜水龙守护神的海底王国「海炎国」，这里因神秘污染和“强行唤醒沉睡水龙”的阴谋陷入危机。利姆露一行人原本是来海岛度假，却被卷入这场深海危机，从悠闲摸鱼被迫营业，潜入苍海深处揭开阴谋、阻止海底文明覆灭。
两千年前，阴阳家后人有感于秦始皇焚书坑儒，叹息于阿房宫付之一炬，为“不教天下才情付之东流”，他开始在文人墨客辞世之时，将其元神凝炼成笔，以保其才情流传后世。两千年后，普通大学生罗中夏意外获得李白的青莲遗笔，从此拥有了笔灵带来的超能力。但好景不长，多方势力都对青莲遗笔的强大力量趋之若鹜，也令罗中夏屡涉险境。为躲避纷争，罗中夏一心寻求退笔之法却接连受挫，反倒开始了一段与“管城七侯”的不解之缘．...
神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
“在寒冷的冬日，与「黄金庭院」的大家一起做些可爱的事情，尽情留下特别的纪念，迎接属于我们的、独一无二的新年——嘿嘿，是不是很有仪式感呀？我想和大家一起创造更多这样美好的回忆，因为……我最喜欢大家了嘛♪”
