在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
在秋天的森林里熊大熊二和光头强之间发生的和秋季有关的系列故事，如赏红枫、处理落叶、森林防火等，为了阻止光头强破坏森林，保卫自己的家园，以熊大熊二为首的丛林动物们和光头强继续展开保卫森林的斗争
罗峰在原始星历练期间，面对异族的觊觎和围剿，丝毫不慌乱，利用自己的智慧和实力反杀对方，维护了人族尊严。“我有一刀，可斩宇宙！”那柄有着震撼人心的美丽战刀，伴随着罗峰一路斩杀！妖族、机械族与虫族再次出现，组成三族联盟，三族首领联合6000名宇宙尊者围剿罗峰，罗峰施展“我为宇宙”的强大威力，将其一举歼灭。
炼体老祖叶苍玄以肉身之力无敌当世，轻松渡劫飞升神界，却因见到九玄大陆灭亡命数，遂决定重返九玄。彼时六大宗门分崩离析，外域邪魔蛰伏待发，于暗处搅动风云。而叶苍玄的逆天改命之途也由此开始，统六宗、闯蛮州、入仙魔、诛邪魔、逆神界，最后与天争雄！
十五年前，丁晓前世在与白衣古神的旷古决战中殒没。十五年后，丁晓七岁结灵胎，特招入镇灵司，却被判定为废相而沦为背棺人，八年来受尽冷眼。 镇灵司分为八部，而灵部与归部夙怨颇深。 机缘之下，丁晓觉醒了相力，在考核赛中成为了归部的英雄，也成为了灵部的眼中钉。与此同时，各地起煞事件越来越频繁。为救妹妹丁灵的怪病，丁晓再次踏上了度化灵煞的征途，随后被卷入到一场惊天阴谋之中，幕后黑手也渐渐浮出水面，而这一切似乎与丁灵的怪病有关。
