神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
这部番外篇围绕的主角是水王子和王默，一人一仙子之间有什么样的缘分，水王子对王默的偏爱，两人神秘的身世等谜题是否会在番外篇揭晓？只能期待更多内容揭晓。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
林越穿越到了鸿蒙大陆，却又被困在同一天整整十万年。无论他如何挣扎，天亮后都会回到昨天。十万年间，林越学会了所有的知识，了解无数宗门强者的秘密，也渐渐认命自己逃不出轮回了。然而，就在十万年的最后一天，林越夺走七业魔皇的未婚妻，砍断太上长老之子的手臂，闯下大祸之后，却发现新的一天为他打开了
