《茶啊二中第六季》时间线来到初三，欢乐的校园日常仍在继续，孩子们迎来了老师、家长们更多的“关爱”，也面临着新的成长挑战，这一季中，大家在校园和家庭生活过程中发生的点滴小事里，凝聚了师生情、友情、亲情的力量，展示了一群平凡却又特别的初中生有笑有泪、真挚动人的青春成长故事。
女皇下旨全城筹办崇圣会，迎奉佛舍利为万民祈福。李唐旧势计划在盛会期间勾结外敌散播舆论，挑起事端，企图造反。并伪造“天罚妖后”的假象。为确保崇圣会顺利进行，女皇委派大理寺少卿李饼彻查旧党党羽，揪出幕后黑手。与此同时，李饼发现，自己喝的药药效逐渐失效，猫的兽性越来越难以控制 。随着案件的调查，关于药的秘密，自己的身世也逐渐浮出水面……
X战警被分散到了各个时间线，从过去，到未来，而他们将在最脆弱的时间点遭遇袭击——如今，1990年代。天启发威，大战来临。
