曾经蓝地星最耀眼的第一宗门星辰宗，意外得到了万界至宝“星辰图”，引来了万界之主的窥视，万界之主为了得到星辰图，诱导星辰宗内的高层前往圣星域，并将他们囚禁在“圣星域”当中。星辰宗只剩下了一个护宗长老诸葛浩瀚以及年少宗主楚星河和几个名年少弟子，因实力不足受到了其他宗门压制，被鹰帮的人夺走了宗门之地，少宗主楚星河为了重新夺回曾经的荣耀，寻找被囚禁的父亲和星辰宗的高层，带领门下几位弟子，连闯十二座星界，打败万界之主的手下十二尊星魂强者，最终也从万界之主救回其父亲和星辰宗所有人。
天赋平平的宣起，原本只是个神通榜上没有排名的神通者，人生理想只是在这一方天地中，安全第一地苟到最后。然而一次外出，他恰好撞见倾城女帝和上古魔物的激战，遭受池鱼之殃。危急时刻，宣起竟然开启了“天秀”系统，获得了“只要展现绝世高手风范，就能不断获得仰望值”的能力。此后，宣起误打误撞，不得不以“神皇转世”的身份登场，看似轻而易举地斩杀上古魔物，更连续击败异魔道高手，从此一朝成名天下知，受到整个大胜神州的敬仰。更神奇的是，他的一言一行总是被误会成大有深意，无数神通者视他若神明，而他也被异魔道当成了心腹大患。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
为复活爱宠菜包，猪猪侠在天才博士的协助下，研发出可承载宠物意识的仿生机器人，并将这项陪伴技术推向全社会。此举遭到超人强、菲菲、波比和小呆呆的集体反对，但猪猪侠依旧执意行动，更试图回到过去升级初代机器人、弥补技术缺陷。不料时空传送失控，他意外坠入未来，亲眼见证世界被失控的机器宠物统治。这些黑化的机械生命体，皆是曾经被人类虐待、遗弃的陪伴机器人。在未来菜包机器人与伙伴们的牺牲守护下，猪猪侠逃回现在欲阻止一切，却发现大BOSS原型机已失踪。未来的阴影，已潜伏当下。
被撤职的锦衣卫袁小棠与青梅竹马的方雨亭为寻找父亲失踪的线索潜入鬼街、在朋友石尧山等人的帮助下，一路逛鬼街、破机关、遇各路神秘人物……乱斗与阴谋轮番上演，随着旧事的重提，一切谜团都渐渐有了答案。
