方寒与同伴前往归虚历练，一路上战天魔、斩神族，又因挑战仙道魁首太一门的权威被逼入太元仙府，反而因祸得福，修为大涨。逃脱生天之后的方寒恪守本心，护持同门，继续谱写属于自己的热血传说。
灵界至尊太子惨遭算计身死，重生跌落凡尘沦为底层杂役！身怀绝世造化神丹与逆天功法，仅凭一柄锈剑掀翻整片武道世界。双武魂同步觉醒，炼化万灵、参悟神魂两道同修，天魔宝库、化龙秘境、远古遗迹尽数踏遍，魔尊铠甲、大荒镜等无上至宝尽收囊中。各路天骄、宗门蛀虫、域外邪族轮番上前找死， 全被他一剑横推、当场碾压！收服龙魂与通灵神犬，护尽身边红颜亲友，踏武王、破武皇、登临武尊，硬撼龙遮天、南宫凌天两大宿敌，撕碎上古黑暗动乱的尘封阴谋。 拳拳炸裂、剑光破穹的3D激战全程无憋屈，越级反杀、秘境夺宝、阵营争锋轮番上演，一路横推强敌，登顶太古至尊！
浮云司“影子”卧底陆尘因破坏魔教降神咒受到黑火诅咒，修为尽毁。度过长达十年的流亡隐居生活后，师父天澜再度现身，交给陆尘前往昆仑派寻找魔教卧底的任务，并且为修复受损的五行神盘，陆尘奉命成为昆仑派百草堂的杂役弟子。在执行任务的过程中，他结识了诸多好友与一生挚爱易昕，逐渐感受到人间温暖，同时从种种蛛丝马迹中触及到了昆仑背后的秘密，发现昆仑禁地封印的黑龙并非邪恶魔物，而一直声称为了大义的天澜竟也另有所图。认清事实的陆尘一时迷茫，在易昕的鼓励下决定正视过去，不再拘泥于所谓正邪之分，而要遵从本心行正确之事。
鬼厉为终结兽神威胁前往镇魔古洞，与陆雪琪联手战胜兽神。鬼王捕获饕餮，与鬼厉反目，两人激战遭幽姬劝止。此时道玄、田不易失踪，鬼厉在义庄与恩师重逢，鬼厉、田不易、陆雪琪三人与入魔道玄大战一场，最终田不易身死。四灵血阵大成，鬼王融合明王之力，攻上青云。危难之际，鬼厉执掌诛仙剑与鬼王殊死一战，拯救苍生。多年后，陆雪琪与隐居草庙村的张小凡重逢。
九界唯一体修至尊，惨遭至交厉云飞背叛，身死道消。 机缘巧合保留神魂不灭，意外降临到青云门将死弟子萧晨身上。 重生一世，萧晨不仅复活，更是天赋觉醒无上神通，更要发誓拿回属于自己的一切，以“诸天尊”的身份走出了自己的神通大道。
第四季《万古仙穹4：银月城篇》接替上季内容，讲述了娲后三魂仅需找到最后一魂便可重生，古海为救小柔，前去银月城阻止大明王神寻到最后一魂。可银月城内却是更加艰险万分，古海将要面对新的挑战。
