神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
墨白身为修仙门派天机门的大弟子，天赋异禀却不好好修仙，一心只想吃遍天下美食。因缘际会中，墨白与妖怪厨师小黑、师妹星红，三人一起组成美食小队，遍历天下寻找异兽美食，却在这旅途中，无意间发现了当年人妖动乱的秘密……
整个宇宙分为域内宇宙和域外宇宙，两个宇宙彼此为敌，域外宇宙由天魔统治，域内宇宙分为神界，仙界，凡间。 在宇宙中，像天罚大陆这样的凡间位面，数不胜数，其统称为：九天星域。九天星域中，九大仙帝统领九重之中所有星域。九天之上，乃炼仙神域，仙人最终化神之路，必要通过炼仙神域，方能凝聚神格，成为神，到达神界。神界万族林立，各族之神极为强大。在遥远的过去，神界万族，被始源至尊、混沌至尊，还有鸿蒙至尊统领。三大至尊，三足鼎立，统管神界、九天仙界。 鸿蒙神界之主鸿蒙至尊，身份尊贵，属下众多，为神界最强之人，精通天下万术。彼
苏小误将自己的血液滴在了收藏的一个古董花瓶上莫名穿越，并且到了一个完全架空的南金朝代成了苏潇。苏潇在南金朝是宰相府的二小姐，为庶出，上面的嫡长姐总是欺压以前的苏潇，甚至抢了她最爱的人，苏潇被人害死，但是还有魂魄存留在苏小的身体里。很快，整个相府都发现了苏潇的不对劲，有的时候自言自语（身体里还有一缕幽魂），穿越而来的苏小也在这个后宅里闹出各种各样的笑话，打脸相府夫人，反击欺负自己的长姐，嫁给王爷做宠妃。
