神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
故事以猫咪的视角瞥见激烈的战场、历史的一瞬、动人的亲情、未来的幻想；通过水墨、二维、三维、定格等多样化形式呈现极具东方韵味的中式美学；十个光怪陆离的有关于猫咪的神秘画卷徐徐展开。
林家倚靠阳元矿石的买卖在炎城慢慢稳定了下来，然而一场突如其来的风波却又让他们损失惨重。林动虽然勉强掩护家人逃离，但是他深知只有自己能力真正的提升才能更好的保护家人。 妹妹青檀忍受寒毒折磨，为了不让哥哥林动担心，仍然表面保持着乐观，并对林动隐瞒寒毒的实情。 炎城符师岩大师为保住符师塔，力邀林动参加塔斗。虽然塔斗危险重重，但是林动出于对岩大师知遇之恩的感激，他依然全力以赴。凭借过人天赋不仅为炎城守住了符师塔，更得到了祖符的神秘信息，而沉睡已久的小貂也在符师塔中复苏。 为给妹妹青檀的寒毒寻得良药，林动与林家宗族队伍林可儿一起前往古墓搜寻宝物，在古墓解封之日，四大家族的顶尖高手悉数到场，绫清竹也在其中。 在古墓中，林动寻得极煞阴龙涎、天鳞古戟等众多宝物。在古墓正殿，邂逅到绫清竹，并目睹了绫清竹收复涅槃心时所展现的强大实力。林动在古墓元灵的引导下，与绫清竹一道...
