神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
末世来临，恐怖笼罩整个世界，地球成为丧尸和变异生物的狩猎场。贫穷少年赵天磊意外获得神秘超级系统，当他目睹眼前人间的惨状，以及身边人的逝去，又怎能做到袖手旁观？！且看拥有超级升级和兑换系统的赵天磊，带领人类与怪异对抗，恢复人类文明！
在人类即将被灭绝之时，六大圣殿崛起，带领着人类守住最后的领土。一名少年，为救母加入骑士圣殿，奇迹、诡计，不断在他身上上演。在这人类六大圣殿与魔族七十二柱魔神相互倾轧的世界，他能否登上象征着骑士最高荣耀的神印王座。
故事发生在历史架空的多元宇宙世界，通过仙道十门之一的羽化门展开。羽化门麾下的大离王朝是一个拥有几十亿人口的人类王朝，每年都会向羽化门进贡宝物和人才，而经过羽化门训教出来的道人以及炼制的法宝，则是玄幻世界的关键所在。
凹凸世界的创世神是一位很肆意随性的神明。他创造了凹凸世界的无数星球和人民，又随心所欲毫无规律地统治着他们——他让有的星球富饶美丽，让有的星球贫瘠荒凉，让有的子民享受自由幸福，又让有的子民承担重税苦役。创世神设立了七神使，让他们代自己推行神的旨意但是，创世神也不是完全不给他的子民机会——如果有谁想改变自己的命运，实现自己的愿望，那么就去参加“凹凸大赛”吧！参赛者将得到大赛系统赐予的“特殊能力”，并锻炼运用各自的能力不断闯关战斗。只要能在凹凸大赛中获得最终的胜利，那么就能得到一切，并赐予你与“七神使”一样代神统治世界的权力。然而，这些都只是虚伪的表象……
塔罗、蒸汽朋克、超能力……周明瑞自异世界而来，加入了这个以疯狂与恐怖为底色的世界，成为了“克莱恩”。
天才技师和肌肉少女的爆笑旅途。
